• 科学家使用DNA序列来表征乳腺癌样本中的基因组

    2019-06-12 14:53:20

    科学家使用DNA序列来表征乳腺癌样本中的基因组重排 2009年12月23日 今天发表了首次详细搜索乳腺癌基因组以揭示基因组重排。该团队描述了人类基因组在24例乳腺癌中被破坏和重新组

      科学家使用DNA序列来表征乳腺癌样本中的基因组重排

      2009年12月23日

      今天发表了首次详细搜索乳腺癌基因组以揭示基因组重排。该团队描述了人类基因组在24例乳腺癌中被破坏和重新组合的方式。重排涉及基因组的重组和重组,包括DNA序列的缺失,重复和新的并置。该研究表明,乳腺癌样本在受基因组重排影响的程度上可能存在很大差异:一些相对不受干扰,而另一些则广泛分裂,然后重新组装,存在200多个重排。虽然众所周知,大多数在血癌中重要的癌症基因都是通过重排激活的,但这一过程在普通成人癌症中的作用却不那么清楚。这项新研究建立在团队的开创性工作基础之上,使用新一代测序技术来描述成人实体瘤的全面重排。 “我们已经研究了DNA序列的水平,以及基因组在许多乳腺癌中是如何分裂和重组的。坦率地说,我们对一些癌症中重排的数量和复杂性感到震惊。“ Wellcome Trust Sanger Institute的Mike Stratton教授说。 “同样重要的是,基因组彼此不同,观察到多种不同的重排模式,支持乳腺癌不是一种,而是几种疾病的观点。”从这项研究中获得的信息将为肿瘤分类增加一个新的维度,从而改进诊断和治疗。在该研究中,该团队使用下一代DNA测序技术生成24个乳腺癌样本中基因组重排的图谱,其中包括乳腺癌的主要亚型,也包括BRCA1和BRCA2乳腺癌家族中出现的乳腺癌的例子。

      

      一种乳腺癌仅显示单一的基因组重排 - 而其他乳腺癌显示超过200种。该研究提供了关于某些癌症中基因组破坏的方式的详细见解,以及癌细胞用于粘合破碎位的过程。基因组又回到了一起。 “看起来有些乳腺癌在维持和修复DNA的机器中存在缺陷,并且这种缺陷导致大量的这些异常,” Wellcome Trust Sanger Institute的Andy Futreal博士说。 “目前我们还不知道缺陷是什么或它背后的异常基因,但我们看到它们在这些基因组的可怕不整洁状态下出现故障的结果。确定潜在的突变原因将是研究某些乳腺癌如何发展的核心。“相关故事吸烟可能导致对黑素瘤的免疫反应减少并降低生存率药物组合可能成为转移性肾癌的一线治疗癌症死亡的种族差异在美国呈下降趋势广泛的重排群体与乳腺癌的不同亚型相关:HER2阳性乳腺癌 - 那些对赫赛汀有反应的乳腺癌 - 具有相似的破坏模式。同样的措施,三阴性乳腺癌,对赫赛汀或激素的治疗​​没有反应,看起来很相似。删除,复制或删除的DNA区域的大小范围从几百个DNA代码到几个大多数变化是同一染色体内的重排,但也有大量涉及两条不同染色体的连接。剖析乳腺癌基因组的复杂性和多样性对于了解癌症的发生方式非常重要。 ,DNA修复系统的明显损失提高了在一些乳腺癌中获得新治疗机会的可能性。“似乎在乳腺癌的不同亚型中,不同的DNA修复机制受损,导致不同类型的基因组解体,”来自癌症研究所突破性乳腺癌研究中心的团队负责人Jorge Reis-Filho博士建议。如果我们使用定制疗法进一步损害已经有缺陷的DNA修复系统,可以选择性地杀死肿瘤细胞,而不会伤害正常细胞。已有一些非常有趣的结果表明,DNA修复缺陷的乳腺癌对引起额外DNA损伤的药物更敏感。“来源:Wellcome Trust Sanger Institute